形成了以系統疾病為基礎，臨床內外科醫技科室及臨床研究實驗室相結合的肝病中心感染中心婦幼中心腫瘤微創介入治療中心泌尿中心五官中心急診中心臨床檢驗中心醫學影像中心臨床病理中心，生物醫學信息中心以及依托首都醫科大學附屬整形外科醫院黃牛掛號電話，效率第一，好評如潮；首都醫科大學附屬北京天壇醫院始建于 1956年8月23日，坐落在世界著名的天壇公園西南側，是一所以神經科為重點的三級甲等大型綜合醫院1997年由中國醫學科學院與北京市衛生局共建成為中國醫學科學院北京天壇醫院和中國醫學科學院。

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首都醫科大學附屬北京友誼醫院原名為北京蘇聯紅十字醫院，始建于1952年是新中國成立后，在蘇聯政府和蘇聯紅十字會援助下，由中國政府建立的第一所大醫院1954年，醫院從甘水橋舊址遷入現址毛澤東主席劉少奇副主席周恩來。

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重點學科是高校在培養高素質創新人才和開展高水平科學研究中具有示范和帶頭作用的學科，是衡量一所高校辦學水平和特色的重要標志在2001年國家重點學科評審中，首都醫科大學的外科學神外眼科學和耳鼻咽喉科學3個學科被；首醫附屬的醫院在北京都是很有名的，宣武，天壇，同仁，安貞，朝陽，這幾個醫院在全國都是知名的大醫院，佑安的肝膽外科很不錯。

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首醫之所以有那么多附屬醫院，是因為它是市屬院校，當初建校時北京還沒有自己的醫學院北醫是部屬院校，不算的，所以得到了政府的大力支持，就把大的市屬醫院都劃作首醫的附屬醫院了。